เอสซีจีพีดำเนินการบำบัดน้ำจากกระบวนการผลิตของโรงงานก่อนปล่อยออกสู่สิ่งแวดล้อม โดยตรวจวัดคุณภาพน้ำอย่างสม่ำเสมอและกำหนดค่าควบคุมคุณภาพน้ำภายในองค์กรที่เข้มงวดกว่ามาตรฐานทางราชการก่อนปล่อยสู่แหล่งน้ำธรรมชาติ ระบบบำบัดรวม การนิคมอุตสาหกรรม หรือส่งให้เกษตรเพื่อใช้ในการเพาะปลูก รวมถึงตรวจติดตามคุณภาพน้ำในแหล่งน้ำธรรมชาติก่อนและหลังโรงงาน โดยการตรวจวัดค่าพารามิเตอร์ต่างๆ ด้วยวิธีมาตรฐาน เพื่อใช้แบ่งประเภทคุณภาพของแหล่งรับน้ำทำให้มั่นใจว่าน้ำทที่ผ่านการบำบัดแล้ว ไม่ส่งผลกระทบต่อธรรมชาติ และแสดงถึงความพยายามของบริษัทในการปรับปรุงคุณภาพน้ำอย่างต่อเนื่อง

เอสซีจีพีศึกษาเทคโนโลยีใหม่ๆ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการบำบัดอยู่เสมอ จัดการฝึกอบรมเกี่ยวกับการทำงานของระบบบำบัดน้ำเสียประเภทต่างๆ ให้กับพนักงานที่เกี่ยวข้องเป็นประจำทุกปี และสนับสนุนให้พนักงานเข้าร่วมการอบรมเรื่องสิ่งแวดล้อมที่จัดขึ้นโดยภาครัฐและภาคเอกชน เพื่อให้พนักงานได้มีโอกาสรับรู้ถึงเทคโนโลยีใหม่ ๆ และสามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการปรับปรุงงานให้ดียิ่งขึ้น

เอสซีจีพีเลือกเทคโนโลยีการบำบัดน้ำประสิทธิภาพสูง โดยการติดตั้งระบบบำบัดแบบไร้อากาศในโรงงานทั้งที่อยู่ในประเทศและต่างประเทศ เริ่มต้นจากบริษัทเอสซีจีพี วีนา คราฟท์ เปเปอร์ ประเทศศเวียดนาม และขยายผลไปยังโรงงานต่างๆ อาทิ บริษัทสยามคราฟอุตสาหกรรม จำกัด (โรงงานบ้านโป่งและโรงงานวังศาลา) รวมถึงโรงงานในประเทศฟิลิปปินส์และอินโดนิเซีย ช่วยลดค่าความสกปรกของน้ำก่อนเข้าสู่ระบบบำบัดแบบใช้อากาศ เพิ่มประสิทธิภาพการบำบัดได้ดียิ่งขึ้น อีกทั้งยังช่วยลดพลังงานและมีผลพลอยได้เป็นก๊าซชีวภาพนำไปใช้เป็นเชื้อเพลิงทดแทนในการผลิตไอน้ำและไฟฟ้า